Описание
Набор реагентов «Human ID» предназначен для генетической идентификации и определения родства человека.
В основе работы набора лежит мультиплексная амплификация 31-го STR-локуса с последующим разделением ПЦР-продуктов методом капиллярного электрофореза.
Из них 26 аутосомных локуса:
D3S1358, D2S441, D1S1656, D19S433, TPOX, D2S1338, TH01, D16S539, CSF1PO, D18S51, D21S11, D6S1043, D22S1045, D8S1179, VWA, D5S818, FGA, D13S317, D7S820, D12S391, D10S1248, SE33, DYS391, D8S1132, D7S1517, Penta D, Penta E
и 5 половых локуса:
Amelоgenin, Yindel, SRY, DYS391, DYS392
Представленные в наборе STR-локусы высоко полиморфны, что позволяет достоверно идентифицировать личность.
В набор входят все локусы баз данных CODIS (Combined DNA Index System) и ESS (European Standard Set), а так же локусы SE33, Penta D, Penta E.
Используемые в наборе праймеры мечены флуоресцентными красителями, детектируемыми в каналах Blue, Green, Yellow, Red, Purple. Стандарт длин СД-520 детектируется в канале Orange. Использование шести красителей позволяет одновременно детектировать продукты ПЦР и стандарт длин в одном капилляре.
| Канал детекции | Локус | Хромосомная локализация | Диапазон аллелей |
|---|---|---|---|
| Blue | Amelоgenin | Xp22.1-22.3 | X |
| Yp11.2 | Y | ||
| D3S1358 | 3p21.31 | 8-21 | |
| D2S441 | 2p14 | 8-17 | |
| D1S1656 | 1q42 | 8-21 | |
| D19S433 | 19q12 | 5.2-20 | |
| TPOX | 2p25.3 | 4-16 | |
| D2S1338 | 2q35 | 10-29 | |
| Green | TH01 | 11p15.5 | 3-14 |
| D16S539 | 16q24.1 | 4-16 | |
| CSF1PO | 5q33.1 | 5-16 | |
| D18S51 | 18q21.33 | 6-28.3 | |
| D21S11 | 21q21.1 | 12-41.2 | |
| D6S1043 | 6q15 | 10-25 | |
| Yellow | Yindel | Yq11.221 | 1-2 |
| D22S1045 | 22q12.3 | 7-20 | |
| D8S1179 | 8q24.13 | 4-20 | |
| VWA | 12p13.31 | 10-25 | |
| D5S818 | 5q23.2 | 6-19 | |
| FGA | 4q31.3 | 12.2-51.2 | |
| Red | SRY | Yp11.2 | SRY |
| D13S317 | 13q31.1 | 5-17 | |
| D7S820 | 7q21.11 | 5-16 | |
| D12S391 | 12p13.2 | 13-28 | |
| D10S1248 | 10q26.3 | 7-21 | |
| SE33 | 6q14 | 3-43 | |
| Orange | DYS391 | Yq11.21 | 6-14 |
| D8S1132 | 8q | 12.1-27 | |
| D7S1517 | 7q31.2 | 16-28 | |
| Penta D | 21q22.3 | 2.2-17 | |
| Penta E | 15q26.2 | 5-25 | |
| DYS392 | Yq11.223 | 3-21 |
Праймеры для ПЦР подобраны с учетом проведения амплификации 31-го STR-локуса в одной пробирке. Размер амплифицируемых ПЦР продуктов находится в диапазоне от 60 до 490 пар нуклеотидов (с учетом всех известных аллелей). Наличие 12-ти mini-STR локусов позволяет получить более полный профиль у деградированных образцов. Анализ результатов ПЦР проводится методом капиллярного электрофореза с использованием автоматических генетических анализаторов (например Нанофор 05).
Для получения полного (по всем 31-ти STR-локусам) генотипа исследуемого образца достаточно 0,125 нанограмм (нг) не деградированной ДНК. Оптимальное количество ДНК, вносимой в реакцию, составляет 1 нг. Диапазон концентраций ДНК для проведения амплификации от 0,125 до 4 нг в реакцию.
Максимальный объем вносимого в реакцию раствора ДНК может составлять 17,5 мкл. Общий объем реакционной смеси – 25 мкл.
Возможно проведение прямой амплификации с использованием FTA карт или образца буккального эпителия, обработанного реагентом «ГенПреп»